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Présentation

Les possibilités de rencontres en bioinformatique sont nées il y a une quinzaine d'années. C'est en 2000 qu'ont eu lieu les premières Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM) qui constituent, à l'heure actuelle, la conférence nationale de bioinformatique. Les éditions précédentes ont eu lieu à Montpellier (2000), Toulouse (2001), Saint Malo (2002), Paris (2003 en conjonction avec ECCB, le congrès européen), Montréal (2004), Lyon (2005) et à Bordeaux en 2006. Marseille prend la suite en 2007.

JOBIM est une réunion francophone de grande ampleur (500 participants à Lyon en 2005, plus de 400 à Bordeaux en 2006) et une occasion unique de confronter des chercheurs d'origines très diverses (biologie, informatique, mathématique, physique) relevant du secteur publique (Universités, CNRS, INRA, INSERM) ou privé (Entreprises de biotechnologies, laboratoires pharmaceutiques).

La Huitième édition de JOBIM se déroulera les 10, 11 et 12 juillet 2007 á l'Ecole de Management Euromed-Marseille sur le campus du Domaine de Luminy dans le 9eme arrondissement de Marseille (carte générale de situation). Des rencontres satellites thématiques auront lieu le lundi 9 et le vendredi 13 juillet. Le campus est situé au sud de Marseille, prés du massif de calanques. Les conférences auront lieu dans le grand amphithéatre et les stands et posters seront disposés dans les halls attenants oú ont lieu les pauses café

Le public visé consiste en l'ensemble des personnes intéressées, activement ou potentiellement, par la recherche en info-bio-math : chercheurs ou enseignants-chercheurs, ingénieurs, étudiants de tous niveau, personnel des entreprises privées ayant des activités de recherche ou de service en bioinformatique ou en biotechnologie.

Les thèmes de JOBIM recouvrent tous les domaines de recherche propres à la communauté incluant, sans y être limité :

La cartographie et l'annotation des génomes.

La recherche de motifs dans les séquences.

La modélisation et la prédiction de structure (des ARN et des protéines).

L'expression des gènes et des réseaux de régulation.

Les interactions macromoléculaires.

La classification fonctionnelle des protéines.

L'évolution et la phylogénie.

L'analyse et classification du métabolisme.

L'algorithmique sur les mots.

Les bases de données et de connaissances.

Les méthodes statistiques et probabilistes.

L'algorithmique et les méthodes combinatoires.

La représentation des connaissances et les ontologies.